色素痣与肉痣，有以下几方面区别：
1.通常色素痣包含肉痣。色素痣在临床上一般可分为三种类型，即交界痣、复合痣和皮内痣，而皮内痣是患者通常所说的肉痣。
2.色素痣在临床上的颜色可以多种多样，可表现为灰色、黑色、白色、红色或者与皮肤颜色相近。而肉痣一般颜色只接近于肤色。
3.色素痣一般可发生于表皮与真皮之间，也可以发生在表皮或者表皮以下，既可以与皮肤表面相平，也可以凸起于皮肤表面。而肉痣一般只发生于表皮或者表皮以下，凸起于皮肤表面。