一般情况下，肛门狭窄并不会导致肛门脓肿。但理论上，也有导致肛周脓肿的可能性。
因为肛门狭窄的患者，会引发出现大便干燥以及便秘的症状，排便不通畅就可能引发肛窦受粪便的刺激，从而可能导致肛窦出现感染而引发肛窦炎。肛窦炎会导致局部组织出现充血、水肿、会堵塞肛腺开口，从而导致患者肛腺腺液分泌不畅，引发肛腺炎。肛腺的炎症，就有可能经肛门括约肌间隙以及淋巴管向肛管直肠周围间隙蔓延，从而导致肛管直肠周围间隙出现化脓性感染，从而形成肛周脓肿。
在临床上，肛门狭窄最容易引发患者出现肛裂，会导致患者出现排便时肛门疼痛以及便血的症状。