先天性肛门闭锁有很多原因引起，主要属于先天性的发育不良，而出现肛门部的闭锁表现，为生后数小时出现恶心、呕吐、黄疸加重，这样就可以基本确定肛门闭锁。
其实肛门闭锁本身诊断并不困难，主要就是治疗的方法，目前以手术治疗为主，手术之后一定要防止后遗症的发生，主要的后遗症就是易于出现肛门失禁，还有就是一些肠道炎症，更有的会出现肠道粘连，甚至出现肠道穿孔和坏死。
所以预防先天性肛门闭锁的后遗症就是很重要的一种治疗方法，即使在没有症状的情况下也建议每半年复查一次，查看是否有复发。