因为慢性化脓性中耳炎而造成耳膜穿孔的患者，需要先针对慢性化脓性中耳炎等炎症感染性疾病进行治疗，之后再根据耳膜穿孔的严重程度选择修复方案。
首先，患者可以使用生理盐水对耳道进行擦拭，将粘附在耳道黏膜上的炎性分泌物清理干净，之后将氧氟沙星滴耳液滴入耳道内，改善耳道以及中耳内的通畅引流，减少中耳内的脓性分泌物的渗出，必要时还可以配合口服阿莫西林等抗生素药物的方式治疗。
待慢性化脓性中耳炎的病情好转后，可以通过耳道检查等确定耳膜穿孔的面积大小，对于面积较小的耳膜穿孔通常可以自愈。而面积较大的耳膜穿孔，可以选择手术治疗。