先天性心脏病可以进行心脏移植。但是先天性心脏病一般应该先通过超声心动检查、心电图、心脏MRI等检查，评估病情的严重程度，再进行手术治疗。若手术治疗效果不显著，患者的先天性心脏病已经逐渐加重，发展为顽固性心力衰竭时，可以考虑对患者进行心脏移植。
但是进行心脏移植并不是一劳永逸的办法，首先手术本身难度较大，风险也非常高。移植手术以后的还可能发生非常严重的排异反应，后续的治疗也很复杂。
所以，先天性心脏病通过早发现、早治疗，可以避免或延缓心脏移植。