妊娠合并再生障碍性贫血，如果轻度贫血者对胎儿影响不大。如果是中重度贫血，会影响胎儿生长，有可能导致流产、早产、胎儿生长受限、死胎及死产等。
妊娠不是再生障碍性贫血的原因，但是妊娠可使原有病情加重。孕妇血液相对稀释，使贫血加重，易发生贫血性心脏病，甚至造成心力衰竭。由于血小板数量减少和质的异常，以及血管壁脆性及通透性增加，可引起鼻、胃肠道黏膜出血。同时外周血粒细胞、单核细胞减少，容易引起感染，再生障碍性贫血的孕妇容易发生子痫前期，使病情进一步加重。
颅内出血、心力衰竭及严重呼吸道、泌尿道感染或败血症，是再生障碍性贫血产妇的重要死亡原因。