小脑萎缩的用药应当根据病因进行选择。如果是由于年龄老化所引起的小脑萎缩，可使用营养脑细胞的药物进行治疗，比如艾地苯醌、辅酶Q10，能够有效的控制小脑萎缩的加重。
如果是血管病所引起的小脑萎缩，应当使用活血的药进行治疗，比如胞二磷胆碱、尼麦角林，能够有效的改善小脑的供血。还应当口服一些预防缺血性脑血管疾病的药物，比如阿司匹林等。
在用药期间患者也要积极的进行康复训练，比如平衡功能训练、吞咽训练等，都有助于提升患者的生活质量。