真菌性甲沟炎会化脓。由于真菌对于周围组织的破坏，而又未得到及时有效的治疗时，局部组织出现坏死从而在周围形成脓肿。
真菌性甲沟炎，需要积极在医生指导下进行抗真菌治疗，并且注意甲沟周围的清洁、卫生，在脓肿形成后，需要及时进行脓肿切开引流，定期换药，促进局部的愈合。如果脓肿范围扩大形成甲下脓肿时，还需要行拔甲手术治疗，术后仍需进行抗感染等对症治疗。
真菌性甲沟炎，通常由于甲沟组织受创伤后真菌感染引起，因此在修剪指甲时不能过短。