神经管畸形通常是跟遗传因素、或者环境因素有关，其次体内缺乏维生素B12及叶酸，或者妊娠早期剧烈呕吐等，都会影响到神经管闭合。
如果胚胎发育期间，神经管闭合时受到影响，也会出现畸形现象，引起神经管畸形。
如果在怀孕期间口服药物或者酗酒时，都会引起神经管畸形。有的女性在怀孕期间也需要口服叶酸，可起到预防神经管畸形的作用。
一般怀孕期间也可通过唐氏筛查、或者B超等方式，能够检查胎儿的发育情况。在孕期是不能口服含激素类的药物，这样会容易出现神经管畸形的。