真菌性鼻窦炎一般是不会发生癌变的。
因为真菌性鼻窦炎主要是由于鼻腔内出现了真菌感染造成的疾病，但真菌感染并不会直接造成鼻咽癌或鼻窦癌等的疾病出现。
鼻咽癌或鼻窦癌等鼻腔恶性肿瘤的发病原因，主要是与长时间的EB病毒及HPV病毒等的感染，以及日常生活中不正确的生活习惯，例如大量吃腌渍类的食品或者是抽烟、饮酒，导致大量的亚硝酸盐或者是焦油，或尼古丁等致癌物质不断地进入鼻腔，诱导了鼻腔部位的细胞出现了异常的突变所造成的。