肩背疼可能是颈椎病造成的疼痛，多发生在颈5/6、6/7节段椎间盘突出后，造成周围组织压迫引起。部分患有肩周炎的患者也会造成肩背部位出现疼痛不适，可以针对该部位进行检查后诊断。
肩背部的软组织损伤后也会引起，在大量的体力劳动中容易造成肩背软组织劳损，或发生急性扭伤而引起疼痛。如肩部肩胛提肌、斜方肌，以及背部菱形肌、冈下肌等软组织长时间反复受到牵拉、刺激，还会诱发无菌性炎症，引起肌筋膜炎，造成疼痛症状加重。