甲状舌管囊肿不能自愈，它属于发育性囊肿，多见于1~10岁的儿童，舌骨上下部最为常见。囊肿生长缓慢，呈圆形，位于颈正中部位，有时微偏一侧、质软、周界清楚，与周围皮肤及周围组织无粘连，随着吞咽及伸舌等动作而移动。
穿刺检查可抽出透明、稍微浑浊的、黄色的稀薄液体。
甲状舌管囊肿可以自行破溃或误诊为脓肿行切开引流，则形成甲状舌管瘘，甲状舌管瘘如长期不治还可以发生癌变。手术彻底切除囊肿或瘘管，否则容易复发，手术的关键是除囊肿或瘘管外一般将舌骨中份一并切除。