跑完步耳膜疼，首先要考虑可能是因为在跑步的时候风过大，耳膜受到风吹的影响，或者是跑步速度过快，所以中耳腔内的压力会发生改变，引起了急性外耳道炎或急性中耳炎，所以会感觉到耳膜疼。检查能够发现耳膜有充血的现象，部分人还会出现头痛的症状。
其次，有可能是因为在跑步的时候，本身就患有扁桃体炎或咽喉炎。如果过度张嘴呼吸，空气并没有经过鼻腔的湿润，直接吸入到咽喉部位，导致咽干、咽疼。当疼痛比较严重时，会放射到耳朵，感觉到耳膜疼痛。