1.排尿困难 结石嵌顿于尿道可引起排尿困难、尿线变细或滴沥状，有时出现尿流中断及尿潴留，完全梗阻则发生急性尿潴留。
2.疼痛 排尿有时有明显的疼痛，且放射至阴茎头部。后尿道结石有会阴和阴囊部疼痛。结石部位有明显疼痛和压痛，若合并感染则局部疼痛加剧，尿道口有脓性分泌物，膀胱刺激症状加剧。
3.肿物 前尿道结石可于阴茎体部触及结节状肿物，尿道外口偶可见露出的部分结石。
4.尿道憩室结石 女性尿道憩室结石主要为下尿路感染症状，有尿频、尿急、排尿痛、脓尿及血尿，性交痛为突出的症状，有时有尿道排脓。男性尿道憩室中结石除尿道有分泌物及尿痛外，在阴茎下方还可出现一逐渐增大且较硬的肿物，有明显压痛但无排尿梗阻症状。有的患者可摸到随排尿压力充气的囊状憩室。