巨人症不治疗的危害主要体现在心血管系统异常、骨关节发育病变及自身的糖代谢出现异常等。另外，巨人症如果不治疗身体会不停生长，在美观上也会造成一定的影响和危害。因此，对于巨人症需要及早发现并积极进行治疗。
患有巨人症的患者一般都会伴有高血压的症状，心脏会发生病变导致心律失常、心功能不全、心肌肥厚等异常。当心血管发生严重的病变也会诱发患者死亡。
巨人症如果不治疗会累及到脊柱及周边的关节，特别是负重的关节容易诱发骨性关节炎。由于生长激素的不断分泌会对身体胰岛素的分泌造成影响，这势必增加了诱发糖尿病的几率和风险。