等孢球虫病的检查项目有：
1.实验室检查项目。实验室检查项目包括血常规、粪便常规。在进行血常规检查时会发现嗜酸性粒细胞有升高现象，通过检查结果还可以了解是否有贫血现象出现。在进行粪便常规检查时，会在显微镜下找出卵囊。
2.活组织检查。如果在进行粪便常规检查时没有发现异常现象，可以进行内镜检查，然后取十二指肠黏膜处的组织进行活检。只要是检查时发现幼虫体存在，即可以确诊。
另外，对于等孢球虫病的患者，除了上述检查方法外，还需要进行体格检查。