甲下外生骨疣绝大部分情况下是不会恶变。
因为该病本身属于一种良性疾病。虽然目前来说，他的病因尚不明确，但是很多患者在切除后进行病理诊断，得出的结论是这些甲下外生性骨疣是些良性病变，目前来说并没有发现恶变的情况。
但是也不能说他100%就一定不会恶变，因为即使是良性肿物，它依然存在着因为后天因素刺激而导致恶变的可能。只不过就目前情况来看，暂时还没有发现甲下外生骨疣恶变的临床案例。如果患者不放心，可以及早的将肿物进行切除。