虹膜囊肿继发青光眼，原则上应尽早手术，在角巩膜缘做一比较大的切口，将囊肿连同受累的虹膜组织一并切除。如果玻璃体脱出，则需要行玻璃体切割术。如果是眼压很高，则先全身或局部用降眼压药物，例如甘露醇静脉滴注，局部滴噻吗洛尔等等滴眼液。如果是虹膜囊肿引起前房炎症渗出，可给予糖皮质激素局部滴药，例如醋酸泼尼松龙滴眼液，每天4次，对于浆液性囊肿，也可以试用激光治疗，用较小的能量击穿囊肿壁，但容易复发。