新生儿期接种的疫苗有乙肝疫苗、卡介苗，一般来说分类并不是单指新生儿期的疫苗，疫苗的种类主要包括三种：
一、活菌疫苗，如卡介苗、麻疹等都属于活菌疫苗，这种疫苗是指菌种没有完全被杀灭，一般接种之后，可能会有轻微的感染的症状；
二、灭活菌疫苗，流感、百日咳等都属于灭活菌疫苗，主要是在血液中形成抗体，从而杀灭病原菌，但是灭活菌疫苗没有增殖性，所以需要多次接种；
三、类毒素，指的是利用甲醛处理细菌毒素，使毒性消失，白喉、破伤风等都属于毒菌素类疫苗，虽然此疫苗没有毒性，但仍然有免疫原性，所以也可以起到免疫的作用。