脑膜炎可能需要做手术，脑膜炎患者如果局部脑组织的感染比较严重，出现脑组织坏死软化，形成脓腔，就可能需要手术清除。
另外，脑膜炎的患者会出现脑内液体循环变差，在脑区进行交换的液体物质，不能通过蛛网膜下腔排泄出去，导致脑积水。脑积水扩大到一定程度，会压迫脑组织，导致脑疝危及生命或导致肢体运动、言语、认知等障碍，所以需要手术解除压迫，引流脑脊液。
另外，脑膜炎如果导致顽固性的癫痫，药物治疗无效时，可能也需要手术破坏导致癫痫的脑区进行治疗。