蕈样肉芽肿和皮肤癌的区别在于发病的原因、临床症状。
从发病原因角度考虑，蕈样肉芽肿本身是与环境、感染、遗传或者自身免疫异常有关。而皮肤癌则有可能是由于遗传因素引发，也有可能是经常生活在有紫外线照射的环境下导致，与X线或β射线也有一定的关系。也有可能是由于某些外界的环境污染，或者某些病原体的感染导致有一定的关系。
从临床症状上，蕈样肉芽肿主要以皮肤表面出现的红斑和明显的斑块为主，这种斑块呈凸起于皮肤的紫色或者是红色的改变，可以形成结节。而皮肤癌所形成的症状主要以凸起于皮肤的破溃、糜烂性的改变为主，表面可以呈现结节样改变。