军团菌肺炎常见的并发症，主要发生于循环系统和呼吸系统。
常见的军团菌肺炎并发症有心肌炎、心内膜炎、心包炎、心力衰竭、呼吸衰竭、急性肾功能衰竭、感染性休克、弥散性血管内凝血、水电解质紊乱、闭塞性细支气管炎、闭塞性细支气管炎伴机化性肺炎等。除此之外，患者还可能出现肝功能受损、意识改变等精神神经症状，严重者可出现肺梗死、脑水肿的表现，从而危及生命。
因此，患者一旦确诊军团菌肺炎后，应立即到当地正规医院的呼吸内科就诊，住院积极治疗，治疗期间应注意防寒保暖，加强营养等。