生化妊娠主要是指在血清中抽血检测出了绒毛膜促性腺激素水平的升高，确认为是怀孕的状态。但是在超声检查下，却没有看到宫腔内有胚胎、胎囊的存在，只是血的生化指标升高，就称为生化妊娠。
生化妊娠激素水平在升高之后又会出现下降，直到恢复到正常水平，这样的情况与自然流产是相似的，但是是没有胚胎组织物排出的。
生化妊娠的主要原因与自然流产是一样的，大多数是由于胚胎本身染色体的异常所导致的，其他的因素还有可能与病毒感染，包括弓形虫、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、风疹病毒等。感染所导致的自然流产或者是由于自身免疫性疾病，也会引起生化妊娠的发生。