生化妊娠时孕酮也会增高的，但是升高的数值比较少，如果是发生了生化妊娠流产，孕酮就会下降。
女性发生生化妊娠多数是由于受精卵质量差，在输卵管内移行的过程中，或者刚刚胚胎到宫腔内尚未着床发育，就会出现自然流产的，这时候发生生化妊娠的初期，也会导致有HCG孕酮水平增高，当生化妊娠流产后就会有激素水平下降。
发生生化妊娠是不能够保胎成功，它是一种自然淘汰过程，妊娠物多数会随着月经血而排出体外。在出血干净后建议行彩超复查，了解子宫的恢复情况。