肺炎链球菌败血症的治疗主要是要及时使用抗生素，如青霉素类或头孢类抗生素治疗。再就是对症治疗，咳嗽明显要使用止咳祛痰药物治疗，如氨溴索、鲜竹沥等。
如果出现寒战、高热，要给予物理降温或使用解热镇痛药物治疗，比如布洛芬、扑热息痛，血压下降要及时补充血容量。如果有呼吸困难、口唇紫绀要注意给予氧疗，采取鼻导管或面罩吸氧，合并脑膜炎出现昏迷烦躁时，要应用营养脑细胞药物及降颅压药物治疗。
总之，需要根据血细菌病原体的检查，白细胞及中性粒细胞的慢性升高，要及时使用抗生素治疗。必要时血细菌培养、药敏试验，使用敏感的抗生素控制感染最重要。