腰痛，如果是腰椎结核核磁共振不能完全检查出来。因为腰椎结核为结核杆菌所引起，磁共振检查只能了解脊髓受压的具体情况和骨质的损坏程度，并不能够确定腰椎部位是否存在结核杆菌。尤其是在疾病早期，核磁共振可发现有骨破坏，但不能确定是炎症、肿瘤，还是结核。因此，仅仅通过核磁共振检测，并不能够确诊为腰椎结核疾病。
要想确诊是否为腰椎结核，还应进行实验室检查，通过综合评估，才可确诊为腰椎结核。
在确诊以后应尽早地使用一线的抗结核药物予以治疗，比如利福平、异烟肼。如果腰椎结核特别严重，还应进行手术治疗。