咽肌麻痹喝水比较困难，吞咽功能可能受到影响，早期很难喝液体食物，但吃固体食物没有障碍，可能导致吸入喉部的危险。
吞咽困难是指由于食物从口到胃和贲门的运输受阻而引起的咽部、胸骨后部或食道阻塞和停滞的感觉，吃液体或固体食物没有困难。
这些病人常有其它神经症症状，咽肌麻痹可分为完全性或不完全性、单侧性或双侧性，单侧瘫痪通常无症状，而双侧瘫痪更为严重。
由于软腭麻痹，鼻咽不能闭合，病人说话时有鼻音，当进入流质饮食时，很容易回到鼻腔，而吃固体食物几乎没有问题。