扁桃体发炎，如果是急性的感染，像急性的扁桃体发炎，病人通常会有持续的高热，39℃~40℃，并且伴有咽喉的剧痛，影响进食。
如果扁桃体肿大明显，可以阻塞咽喉，导致病人有咽堵甚至有呼吸的障碍。如果是慢性的扁桃体炎，通常病人会由于急性扁桃体炎反复发作、迁延不愈导致，病人可能会有长期的低热，或者是每年反复地发生急性的化脓性扁桃体炎。
长期的扁桃体炎，可以导致扁桃体的肥大、阻塞咽腔，导致病人打鼾，造成呼吸睡眠暂停综合征。还有少数病人，因为长期的慢性发炎，可以导致远期的并发症，像风湿性心脏病、风湿性关节炎、肾炎等。