角膜炎治疗的原则为积极控制感染，减轻炎症反应，促进溃疡愈合，减少疤痕形成。抗生素，对细菌性角膜炎选用敏感的抗生素，首先根据经验和疾病严重程度，使用对病原体有效的或广谱抗生素，待实验室检测结果明确后再做调整。对真菌性角膜炎，主要用抗真菌药物。对于单疱病毒性角膜炎，可使用高选择性抗疱疹病毒药物。糖皮质激素要严格掌握适应证，使用不当可使病情恶化甚至角膜穿孔。
细菌性角膜炎急性期应该禁用，在慢性期病灶愈合后可以酌情使用。真菌性角膜炎也要禁用。对单疱病毒性角膜炎原则上只能用于非溃疡性的角膜基质炎。并发虹膜睫状体炎时可用阿托品散瞳。药物治疗无效、溃疡穿孔或将要穿孔者，应采取治疗性角膜移植术，清除病灶，术后继续药物治疗。