可以通过以下一些检查方法诊断肛窦炎：
首先，是体格检查。主要是肛门指诊，肛窦炎的患者在肛门指诊时，可触及齿状线处炎性肿大的肛窦，可触及肛窦处的硬结，并且会伴有局部按压疼痛，急性肛窦炎的患者在挤压后会有脓性分泌物。
其次，是内镜检查。主要是肛门镜检查，在肛门镜下可以看到局部红肿的肛窦，局部可见脓性分泌物。
再次，是实验室检查。对于急性肛窦炎如果感染症状比较严重的，有可能会造成血液中的炎性指标增高，例如会造成白细胞或者C-反应蛋白等升高。