颅内的缺氧、出血、颅内感染，以及一些常见的代谢异常引起的体内低血糖、低血钙、低血镁、高钠及维生素B6缺乏都可以引起。
新生儿惊厥是大脑皮质功能暂时紊乱引起脑细胞异常放电，它的表现可以使全身性，不自主地肌肉收缩。在新生儿窒息引起缺氧缺血性脑病的时候，可以有肌张力低。惊厥一般在12小时左右出现，这个时期颅内压增高，严重的还会出现颅内出血。根据颅内出血的部位，患儿可出现局灶性的阵挛性惊厥。
由于各部位的感染透过血脑屏障导致的化脓性脑膜炎，围产缺氧没有及早开奶的时候会出现低血糖。如果出生体重低以及新生儿有甲状腺功能不全的时候，会有低血糖发生、维生素B6缺乏。