脚趾甲变厚并非一定是灰指甲，虽然灰指甲可以使脚趾甲变厚的症状，但除了会出现脚趾甲变厚的症状外，还伴有趾甲内空洞有粉末，趾甲表面失去原有光泽，而且进行真菌化验表现为阳性。
如果进行真菌化验属于阴性，则考虑可能是指甲营养不良引起的，常见于平时饮食习惯不好的人群，也可见于慢性疾病造成身体虚弱的人群，都可造成机体营养不良进而引起指甲营养不良，就会出现脚趾甲变厚。
除此以外，某些内科疾病导致血运不良，也可能出现脚趾甲增厚的现象。