病毒性胃肠炎一般不用头孢他啶。病毒性胃肠炎治疗上一般不需要使用消炎药，常规调整饮食结构，补液及对症支持治疗后患者腹痛、恶心、呕吐、腹泻等症状能够好转。部分轻症患者甚至不用治疗也能恢复。
如果患者出现发热，抽血化验血常规提示白细胞和中性粒细胞明显升高，C-反应蛋白也明显升高，提示合并肠道细菌感染，多合并革兰氏阴性杆菌感染，这种情况下可以用消炎药。比如左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星等，还可以选用三代头孢类消炎药，比如头孢他啶。但是用药时间不宜过长，否则容易引起肠道菌群失衡。