在临床上，癌胚抗原是能够帮助查出一部分胃癌。
在一部分胃癌的病人当中，可以出现癌胚抗原增高的情况，还有一些病人可以表现为癌胚抗原和糖类抗原199以及糖类抗原724都增高这样一个情况。三种肿瘤标志物的同时性增高，对于早期发现和诊断胃癌具有更大的临床意义。
尤其是当这些肿瘤标志物出现进行性增高的情况下，更能给临床医生以提示，会给病人进行胃镜、肠镜的检查，观察胃内或者肠内是否有可疑癌症的病变存在。
必要的时候，还可以进一步取组织做病理学检查，明确是不是胃癌这样一个诊断。