甲状舌管囊肿属于发育性囊肿，它多见于一到十岁的儿童。舌骨上下部最为常见，囊肿生长缓慢，呈圆形。临床上常见者多如胡桃大，位于颈正中部位，有时微偏一侧、质软、周界清楚，与周围皮肤及周围组织无粘连。
一般随吞咽及伸舌等动作会出现移动，而穿刺检查可抽出透明、微浑浊的黄色稀薄液体。甲状舌管囊肿可以自行破溃或误诊为脓肿行切开引流，则会形成甲状舌管瘘。
甲状舌管瘘如长期不治，还可以发生癌变。手术彻底切除囊肿或瘘管，否则容易复发。手术治疗是除囊肿或瘘管外，一般将舌骨中分一并切除。