导致胚儿停止发育的原因比较多，主要包括以下几个方面。
首先最为常见的原因为染色体异常，临床上18三体、21三体等一些染色体异常是最为常见的胚胎染色体异常，可以导致胚胎停止发育。
其次为感染性的因素，孕妇在怀孕期间出现生殖道感染或者其他病毒感染，都有可能导致胚胎停止发育。
第三，免疫因素和内分泌因素，孕妇如果体内激素分泌紊乱，会有可能导致胚胎停止发育。
第四，环境因素以及母体自身情况，也会导致胚胎停止发育。