甲状腺囊腺瘤是甲状腺的良性肿瘤，对于体积比较小的甲状腺囊腺瘤，没有临床症状的一般不需要治疗，注意观察，定期复查甲状腺彩超和甲状腺功能。
如果甲状腺囊腺瘤生长比较大，囊内有出血，突然增大并伴有疼痛症状，或者压迫气管、食管或神经，产生呼吸困难、吞咽困难或声音嘶哑、呛咳的临床症状，或者有甲状腺功能亢进的明显症状，又或者出现恶变倾向，需要尽早进行手术切除，标本常规送病理检查。
手术后，要注意定期复查甲状腺的彩超和甲状腺功能，不要吃含碘比较高的食物。