偏头痛做核磁共振检查是检查不出什么原因的，主要是因为偏头痛本身病因就不是很明确，而核磁共振在进行检查的时候偏头痛的患者通常都没有什么异常的表现。
对于怀疑偏头痛的患者，一般去神经内科就诊以后，医生根据患者典型的病史以及临床表现，基本上就可以诊断患者是否有偏头痛。
做核磁共振检查通常是为了排除一些其他的能够导致头痛的疾病，比如脑血管的病变、脑部的占位性病变等。怀疑偏头痛的患者一般也需要做一些检查，比如血液化验检查、脑电图检查、经颅多普勒检查等，通常这些检查会有一些阳性的表现。