目前对于乳管内乳头状瘤形成的原因还没有确定，较多患者的病情与雌激素过度刺激，所造成局限性乳头状生长有关，还有些患者与以下原因有关：
一、是乳管内长期有分泌物，使乳管内受到了刺激，并且分泌物没有从乳管开口处排出，反而一直堆积在乳管内，这样会使乳管上皮长期受到刺激发生炎性改变、水肿等状况，还会造成局部组织的增生、隆起，造成乳头状瘤的形成。
二、是由于腺泡组织、纤维组织等形成了结节状态，从而堵塞了乳管，从而造成乳管内乳头状瘤的发生。