结肠瘘如何治疗还是在于结肠瘘的严重程度，结肠瘘主要还是发生在存在腹部手术中的情况，多见肠道手术。
结肠瘘存在小的瘘口和大的瘘口的情况，对于小的瘘口是可以采取双套管反复冲洗及充分引流处理的，冲洗后瘘口处没有渗出流出则是可以长好的。如果较大的瘘口，还是建议采取手术肠造瘘处理为好，肠瘘严重的可以出现腹腔内感染及感染性休克。
如果为恶性肿瘤术后引起的并发症，在肠造瘘术后切口恢复好的情况下。需要及时化疗治疗，以免出现恶性肿瘤复发及转移。