季节性咳嗽不治疗部分会自愈，部分不会。季节性咳嗽包含许多疾病种类，引起季节性咳嗽的疾病有严重程度的区别。
如果是过敏性哮喘引起的季节性咳嗽，轻度时脱离产生过敏反应的环境后能够自行恢复正常。一旦哮喘急性发作，出现气喘等症状时，需要立即用药缓解症状，减轻喘鸣，恢复正常的气道通气，包括使用止咳平喘药和效果更好的糖皮质激素药。
如果是由上呼吸道感染引起的季节性咳嗽，通常在2周左右即可自愈。无感染时不需要使用消炎的药物进行治疗、缓解季节性咳嗽的症状。