如果两侧肾都因结石导致肾结构严重破坏、功能丧失，并且合并有其他并发症，就需要行肾移植手术，但是发生这种情况的几率很小，不必太担心。
目前治疗肾结石的方法还是很成熟的，但是因为尿石症复杂多变，再有结石的性质、大小、部位、患者个体差异等因素，其治疗方法和效果也有所不同。
如果结石小于0.6cm，没有尿路梗阻等情况，可以采用药物排石，治疗期间多饮水，即可达到很好的疗效。如果结石大于2cm，并且位于输尿管上段，可选择体外冲击波碎石。此外目前常采用的还有经皮肾镜碎石取石术、输尿管镜取石术等，如果治疗效果不好或病情复杂，也可采用开放手术。