小儿抽风如果只是单纯的高烧引起的，一般没有后遗症，也不影响智力发育。但如果病情复杂或反复发作，可能会有后遗症。
如果初始年龄不足1岁，会使大脑代谢不全，影响神经功能，并往往留下一定程度的后遗症。预后越差，约50%的人会有智力低下。复发次数越多，预后越差，复发10次以上的儿童，有50%会留下后遗症。
如果发作持续20分钟以上，会对脑细胞造成损伤，超过30分钟会使半数患者出现不同程度的神经功能障碍。