小儿败血症少部分是会留下后遗症，但大部分孩子是没有后遗症，出现后遗症可有以下几种：
1.影响智力，一般小孩患上败血症，只要得到积极治疗与控制，败血症可以是没有任何后遗症。但如果耽误了治疗或是新生儿败血症伴随其它严重的并发症，则会导致高胆红素血症以及化脓性脑膜炎产生，而这些疾病都有可能会影响到智力发育，就算后期化脓性脑膜炎得到治愈，也不能保证不影响孩子的智力。
2.其它后遗症，如果情况较为严重的败血症，并且没有得到很好的治疗，会引起脑积水、脑萎缩、听力障碍、营养不足、消化不良以及慢性腹泻等等。