导致肛门疼痛难忍的原因主要有以下几个，患者需要去正规医院找肛肠外科医生就诊检查明确原因，再采取相对应的治疗方法：
第一，肛周脓肿，是肛门周围化脓感染性疾病，导致患者肛门周围剧烈的疼痛，疼痛症状呈进行性加重，肛门周围也会有局部红肿硬块，脓肿成熟时会出现明显的波动感。
第二，痔疮，当患者出现血栓性外痔、炎性外痔或者内痔、混合痔脱出伴嵌顿时也会导致剧烈的疼痛症状，在患者肛门周围可触及肿大的痔核。
第三，肛门周围恶性肿瘤也会导致肛门疼痛难忍，在肛管或者肛门周围可触及质硬的肿块，边界不清。