食管囊肿摘除的费用一般在3000-5000元不等，食管囊肿摘除术的费用需要根据就诊的医院、就诊的地区、患者的自身情况、手术的方式等综合判断。
一般情况下食管囊肿比较的小，患者没有明显的症状出现，可以暂时不进行手术治疗。
如果囊肿比较的大，而且压迫到气管会引起呼吸困难，甚至还会出现喘鸣，如果囊肿所分泌的液体不断的增加，就可能会导致出血，增加感染的几率，这个时候就需要进行手术治疗，手术的时候多选择胸腔镜来进行微创手术切除。