肛瘘挂线手术有两种，其手术的目的也不相同。
第一，挂虚线，其主要目的是起到引流的作用，一般不涉及内口的治疗，是在各个外口之间用橡皮筋或者引流管挂线，在一些非常复杂的肛瘘，需要分期手术时，也有可能会在内口处挂虚线，二期再行根治性手术。
第二，挂实线，用于高位肛瘘内口的处理，手术时将橡皮筋自外口穿入、内口穿出，切开外口和肛缘之间的皮肤以及皮下组织，收紧橡皮筋使橡皮筋保持一定的张力，这样就可以使橡皮筋起到切割组织的作用，将内口切开，可以防止因内口一次性切开导致的肛门失禁。