肛瘘手术是选择挂线好，还是切除好，要根据患者的病情来决定，只有适合患者病情的手术方式才是最好的。
如果低位性的肛瘘，临床大多选择肛瘘切除术。如果是复杂性高位肛瘘，需要做挂线术。如果是高位肛瘘，因为内口位置较高，如果做直接切除术，会容易损伤肛门括约肌，而导致肛门失禁。而且高位性肛瘘可能存在有多条瘘管，瘘管走向较复杂，需选择挂线术，尽量避免对肛门括约肌的损伤。
因此肛瘘手术要根据患者的病情来选择，不可以一概而论。