新生儿低钙血症不会自愈的，针对不同的病因要用药治疗。引起新生儿低钙的原因有可能和喂养或者宫内缺氧以及母亲的患一些疾病有关系，所以针对不同的病因应用药物或者改善喂养方式来纠正低钙血症。
牛乳中的钙磷比例不适宜孩子吸收会导致低钙。这种情况除了给孩子补充钙剂，提倡母乳喂养。如果母亲患有甲状旁腺功能亢进引起的孩子甲状旁腺功能被抑制，引起孩子顽固性低钙血症，需要补充钙剂，而且要补充维生素D2。
如果是因为缺氧细胞破坏增加引起的钙磷结合，导致的低钙。除了治疗缺氧以外，可以给孩子先适当的补充钙剂。