手指甲上出现凹陷的原因有很多，比较常见的还是真菌感染引起的灰指甲，是由于真菌感染之后破坏了甲床，而引起的局部指甲不能生长，可以外涂特比萘芬软膏或者盐酸伊曲康唑软膏或者是霜剂，症状严重时，也可以直接口服。
再有就是外伤，外伤可以使甲板损伤，但是有可能慢慢恢复正常状态。其他便是缺乏维生素或其他营养物质，多见于一些儿童才会出现的问题。补充营养之后，自然可以恢复到正常状态。
无论是何种原因引起，平时要多注意吃优质蛋白肉类，多吃蔬菜、水果，增强体质，都可以使手指甲上有凹陷的问题解决。